吉林应用数学中心成立于 2019 年 9 月 29 日，该中心由省科技厅 会同省教育厅和中科院长春分院组织，由吉林大学联合东北师范大学 和吉林省计算中心等单位共同建设。2020 年 2 月 26 日，经科技部遴 选，成为首批获得支持建设的 13 个国家应用数学中心之一，更名为 吉林国家应用数学中心。这也是继国家天元数学东北中心之后，依托 我校建设的第二个国家级数学中心。